Inhoud
In de 19e eeuw was taxonomie - de classificatie van levende organismen - een ware woede in de biologie. Zowel amateur- als professionele natuuronderzoekers waren zo verstrikt in de rage van het verzamelen en identificeren van wezens, zeldzame kevers waren hete handelswaar. In die tijd was er weinig bekend over micro-organismen en hun plaats in de wereld van levende wezens, en de classificatie van microbiologie kreeg niet zoveel aandacht. In de tussenliggende decennia is de kennis over microben en methoden voor het identificeren van micro-organismen dramatisch toegenomen, waarvan een deel is aangetoond door de efficiënte classificatie van micro-organismen.
Componenten van taxonomie
Taxonomie bestaat uit drie componenten: nomenclatuur, classificatie en identificatie. Nomenclatuur is gewoon een naam toewijzen aan een soort. Classificatie is het groeperen van soorten volgens gedeelde kenmerken - waarvan sommige fysisch zijn, en sommige biochemisch. Identificatie gebruikt kenmerken van een organisme om te bepalen waar het in een classificatieschema thuishoort. Het moderne taxonomische schema heeft de grootste, meest inclusieve groep, de domeinen. De kleinste groep is de soort. Van de meest inclusieve tot de meest specifieke, de niveaus lopen als volgt: domein, koninkrijk, fylum, klasse, orde, familie, geslacht en soort. U bent bijvoorbeeld Eukarya Animalia Chordata Mammalia Primate Hominidae Homo sapiens.
Micro-organismen en domeinen
Micro-organismen zijn zeer divers. Ze worden niet bepaald door een bepaald soort structuur of functie, maar eenvoudig door hun grootte. Micro-organismen zijn zo divers dat ze binnen alle drie de verschillende classificaties op het hoogste niveau vallen - alle drie de domeinen. Het ene domein is bacteriën, het andere is archaea en het laatste is eukarya. Alle leden van de bacteriën en archaea-domeinen zijn eencellige micro-organismen. Ze zijn beide cellen zonder membranen die hun genetisch materiaal van de rest van de cel scheiden - membranen die een kern definiëren. Dus alle koninkrijken, phyla, klassen, orden, families, geslachten en soorten binnen de bacteriën en archaea-domeinen zijn micro-organismen.
Eencellige protisten
Eukarya zijn organismen waarvan de cellen een kern bevatten. Veel eukaryotische organismen zijn eencellige micro-organismen, maar vele anderen - zoals redwood bomen, of u - zijn dat niet. Er zijn dus aanvullende classificaties nodig. Het koninkrijk Protista binnen het domein Eukarya bestaat uit alleen eencellige micro-organismen. De protisten zijn gescheiden in drie verschillende groepen phyla: vier verschillende algen phyla, vier verschillende protozoa phyla en twee verschillende schimmel phyla. Maar alle organismen in deze phyla - allemaal in het koninkrijk Protista - zijn micro-organismen.
Microscopische schimmels
Het koninkrijk Fungi bevindt zich binnen het domein Eukarya. Sommige van de phyla in de schimmels bevatten micro-organismen. Het phylum Zygomycota bevat bijvoorbeeld microscopische broodvormen en het phylum Ascomycota bevat gisten en microbiële gewasplagen en parasieten. Lichens zijn een symbiotische verzameling van een schimmel en een fotosynthetisch organisme - deels opgenomen in de Kingdom Fungi en deels in andere koninkrijken, of zelfs andere domeinen.