Inhoud
Ribonucleïnezuur of RNA speelt verschillende vitale rollen in het leven van een cel. Het fungeert als een boodschapper, die de genetische code van deoxyribonucleïnezuur of DNA doorgeeft aan de eiwitsynthesemachine van de cel. Ribosomaal RNA voegt zich samen met eiwitten om ribosomen te vormen, de eiwitfabrieken van de cel. Breng RNA-shuttles aminozuren over in groeiende eiwitstrengen terwijl ribosomen messenger-RNA vertalen. Andere vormen van RNA helpen de celactiviteit te beheersen. Het enzym RNA-polymerase, of RNAP, dat verschillende vormen heeft, is verantwoordelijk voor het verlengen van de RNA-keten tijdens de transcriptie van DNA.
RNA-polymerasestructuur
In eukaryotische cellen - dat wil zeggen cellen met georganiseerde kernen - worden de verschillende RNAP-typen aangeduid met I tot V. Elk heeft een iets andere structuur en creëert elk een andere set RNA's. RNAP II is bijvoorbeeld verantwoordelijk voor het maken van messenger RNA of mRNA. Prokaryotische cellen (die geen georganiseerde kernen hebben) hebben één type RNAP. Het enzym bestaat uit verschillende eiwitsubeenheden die verschillende functies uitvoeren tijdens transcriptie. Een actieve plaats die een magnesiumatoom bevat, is de plaats in het enzym waarop RNA verlengt. De actieve plaats voegt suiker-fosfaatgroepen toe aan de groeiende RNA-streng en hecht nucleotidebasen aan volgens de basenpaarregels.
Basis koppelen
DNA is een lang molecuul met een ruggengraat samengesteld uit afwisselende suiker- en fosfaateenheden. Een van de vier nucleotide basen - enkel- of dubbel omringende moleculen die stikstof bevatten - hangt af van elke suikereenheid. De vier DNA-basen zijn gelabeld A, T, C en G. De sequentie van basenparen langs het DNA-molecuul dicteert de sequentie van aminozuren in de eiwitten die door de cel worden gesynthetiseerd. DNA bestaat meestal als een dubbele helix waarin de basen van twee strengen aan elkaar binden volgens basenparingsregels: de A- en T-basen vormen één set paren, terwijl C en G de andere set vormen. RNA is een verwant, enkelstrengig molecuul dat dezelfde basenpaarregels volgt tijdens DNA-transcriptie, behalve de substitutie van de U-base voor T in RNA.
Transcriptie-initiatie
Eiwitinitiatiefactoren moeten een complex vormen met een molecuul RNA-polymerase voordat de transcriptie kan beginnen. Deze factoren zorgen ervoor dat het enzym kan binden aan promotorgebieden - bevestigingspunten voor verschillende transcriptie-eenheden - op een DNA-streng. Transcriptie-eenheden zijn sequenties van een of meer genen, die de eiwit-specificerende delen van een DNA-streng zijn. Het RNA-polymerasecomplex creëert een transcriptiebel door een deel van de dubbele DNA-helix aan het begin van de transcriptie-eenheid open te ritsen. Het enzymcomplex begint dan RNA samen te stellen door de DNA-matrijsstreng één base tegelijk te lezen.
Verlenging en beëindiging
Het RNA-polymerasecomplex kan veel valse starts maken voordat de verlenging begint. Bij een valse start transcribeert het enzym ongeveer 10 basen en breekt vervolgens het proces af en start opnieuw. Verlenging kan alleen beginnen wanneer het RNAP de initiërende eiwitfactoren vrijgeeft die het aan het DNA-promotorgebied verankeren. Zodra de verlenging aan de gang is, roept het enzym verlengingsfactoren op om de transcriptiebel door de DNA-streng te helpen verplaatsen. Het bewegende RNAP-molecuul verlengt de nieuwe RNA-streng door toevoeging van suikerfosfaateenheden en nucleotidebasen die de basen op het DNA-sjabloon aanvullen. Als de RNAP een verkeerd gepaarde base ontdekt, kan deze het dolende RNA-segment splitsen en opnieuw synthetiseren. Transcriptie eindigt wanneer het enzym een stopsequentie op het DNA-sjabloon leest. Bij beëindiging geeft het RNAP-enzym het RNA-transcript, de eiwitfactoren en de DNA-matrijs vrij.