Inhoud
- Algemene DNA-extractie
- Plantaardige en dierlijke cellen
- Plant DNA-extractie
- Dierlijke DNA-extractie
- De DNA-verschillen
De structuur van dubbelstrengs DNA is universeel in alle levende cellen, maar er zijn verschillen in de methoden voor het extraheren van genomisch DNA uit dierlijke en plantaardige cellen. Hoewel genomisch DNA in de kern van cellen leeft, hangt de hoeveelheid en zuiverheid van geëxtraheerd DNA af van het type en de grootte van de cel. Bepaalde cellen bevatten bijvoorbeeld meer DNA en onzuiverheden dan andere. Lees verder voor meer informatie over verschillen in DNA-extractie.
Algemene DNA-extractie
Als u plantaardige en dierlijke cellen met een zeepachtige substantie behandelt, zullen de lipiden in de cel en de nucleaire membranen worden afgebroken. Vervolgens scheidt het DNA-mengsel zich van de celmembranen en eiwitten. Vervolgens kunt u alcohol gebruiken om het DNA in de oplossing neer te slaan. Afhankelijk van de hoeveelheid in het monster kan DNA zichtbaar zijn met het blote oog. Houd er echter rekening mee dat deze eenvoudige procedure niet noodzakelijkerwijs DNA met een hoge zuiverheid produceert.
Plantaardige en dierlijke cellen
Plantencellen verschillen van dierlijke cellen vanwege hun stijve celwand en organellen zoals de chloroplast. Ze bevatten ook eiwitten en enzymen die een rol spelen bij fotosynthese. Sommige plantencellen hebben polyploïdie, wat betekent dat ze meer dan één kopie van elk chromosoom per cel hebben. Bovendien produceren cellulaire processen die in planten voorkomen, zoals fotosynthese, een reeks secundaire metabolieten. Dierlijke cellen hebben geen celwand, maar hebben nog steeds chemicaliën zoals natriumdodecylsulfaat (SDS) nodig om het celmembraan te verstoren en genomisch DNA vrij te maken.
Plant DNA-extractie
Genomisch DNA van planten is moeilijker te extraheren vanwege de celwand van de plant. Je kunt het verwijderen door homogenisatie of door cellulase toe te voegen om de cellulose die de celwand vormt af te breken. Bovendien kunnen de metabolieten in de plantencel de genomische DNA-extractie verstoren door het DNA-monster tijdens het neerslagproces te verontreinigen.
Dierlijke DNA-extractie
Perifere bloedleukocyten zijn de belangrijkste bron van genomisch DNA van dieren, maar het verzamelen van monsters is moeilijk omdat het bloed rechtstreeks van het dier moet komen. Bloed bevat een reeks verbindingen zoals eiwitten, lipiden, witte bloedcellen, rode bloedcellen, bloedplaatjes en plasma, die het DNA-monster kunnen besmetten. De primaire contaminant van dierlijk DNA dat uit bloedmonsters wordt geëxtraheerd, is heem, wat de niet-eiwitcomponent van hemoglobine is.
De DNA-verschillen
De verschillen tussen plantaardig en dierlijk DNA liggen in de reeks basen in de helix. Verbindingen gevonden in plantencellen zijn afwezig in dierlijke cellen en DNA-basesequenties weerspiegelen dit. Ook is het genomische planten-DNA vaak groter dan dierlijk DNA. Deze verschillen hebben ook invloed op extractiemethoden, opbrengst en de zuiverheid van DNA.