Inhoud
- Definitie van genotype
- Het genotype kennen: Punnett Square
- Polymerasekettingreactie
- Hybridisatiesonde
- Directe DNA-sequentiebepaling
De term genotype verwijst naar de volledige genetische samenstelling van een organisme. Het wordt ook gebruikt bij het beschrijven van de verschillende variaties van een gen, bekend als allelen. Mensen hebben twee allelen voor elke genetische positie of locus.Tezamen wordt elk paar allelen als een specifiek genotype beschouwd.
Het kennen van het genotype of een genotype-voorbeeld van een individu kan belangrijk zijn voor het begrijpen van genetische expressie, het diagnosticeren van ziekten, leren over genetische mutaties en meer.
Definitie van genotype
Laten we beginnen met een specifieke definitie van genotype. Een genotype van een individu is de erfelijke genetische informatie waarover die persoon beschikt. Dit verwijst naar je genen, DNA, allelen, enz. In één allesomvattend woord. Een voorbeeld is het beschrijven van een bloemenkleurgenotype als RR (wat betekent dat ze twee "rode" allelen, RR, voor hun kleur hebben) of Rr (één "rood" allel, R, en één "roze" allel, r, voor kleur) .
Je fenotype daarentegen is wat en individu fysiek laat zien dat wordt bepaald door het genotype dat ze hebben. Hoewel twee personen hetzelfde fenotype kunnen hebben, kunnen ze compleet verschillende genotypen hebben. In navolging van het bloemvoorbeeld uit eerder, lijken zowel de RR- als de Rr-bloemen rood omdat rood dominant is over roze. Ze verschillen echter in hun genotype omdat men homozygoot (RR) en één heterozygoot (Rr) is.
Lees meer over de definitie, allelen en voorbeelden van genotypen.
Het genotype kennen: Punnett Square
Een Punnett-vierkant is een van de eenvoudigste manieren om het genotype te bepalen. Het vierkant is eigenlijk een minigrafiek die wordt gebruikt om het potentiële genotype voor een nageslacht te bepalen met betrekking tot een bepaalde eigenschap.
Om een Punnett-vierkant te maken, schrijf je alle mogelijke allelen over de bovenkant van het vierkant voor de ene ouder en alle mogelijke allelen voor de andere ouder aan de linkerkant. Elk vermeld allel wordt binnen het vierkant een kolom, voor topallelen, of een rij voor linkerallelen. Het vierkant wordt ingevuld terwijl je allelen van boven in hun respectieve kolommen noteert en vervolgens allelen van de zijkant in hun respectieve rijen noteert, waardoor een vierkant vol met potentiële genotypes ontstaat.
Een voorbeeld van een genotype dat het Punnett-vierkant gebruikt, zijn de klassieke erwtenexperimenten uitgevoerd door Gregor Mendel. Bekijk hier specifieke voorbeelden van genotypen en Punnett-vierkanten.
Polymerasekettingreactie
Ontwikkeld in de jaren 1980, genereert polymerase kettingreactie (PCR) een specifieke standaard van DNA op basis van een sjabloonstreng. Naast een matrijsstreng zijn DNA-polymerase, nucleotiden en korte stukjes enkelstrengs DNA nodig voor een PCR-reactie.
Op een bepaald punt begint de PCR-reactie exponentieel kopieën te genereren, en alleen tijdens deze fase is het mogelijk om de oorspronkelijke hoeveelheid van de doelsequentie in het monster te bepalen. De methode wordt gebruikt voor sequentiëring, klonering en genetische manipulatie.
Lees meer over de verschillen tussen PCR-klonen.
Hybridisatiesonde
Een hybridisatieprobe wordt gebruikt om te bepalen of een fysiek kenmerk te wijten is aan genotype. Het proces begint met de volledige ontsluiting van het te analyseren DNA, gevolgd door de overdracht ervan naar een filtermembraan. Vervolgens wordt de probe aan het filter toegevoegd en mag deze binden aan een doelsequentie.
Na ongeveer 24 uur wordt het filter gewassen om alle niet-gebonden probe te verwijderen. Een hybridisatieprobe kan ook worden gebruikt om de effectiviteit van een kloneringsproces te bepalen of het aantal exemplaren van een specifiek gen te achterhalen.
Directe DNA-sequentiebepaling
Het Human Genome Project leidde tot de ontwikkeling van een aantal krachtige DNA-sequencing-tools. Naast het decoderen van het volledige genoom van Homo sapiens, hebben deze tools wetenschappers in staat gesteld de complete genomen van talloze andere organismen te sequencen, waaronder muizen, ratten en rijst. Met geavanceerde sequencing-tools kunnen de genetici van vandaag grote hoeveelheden DNA snel en goedkoop vergelijken en manipuleren.
Dit zal het mogelijk maken om de rol van genetica bij de vatbaarheid voor ziekten, de genetische respons van organismen op prikkels uit de omgeving en het traceren van de evolutie van een eigenschap of soort te traceren, volgens het National Human Genome Research Institute.