Inhoud
- DNA, genen en allelen
- Allelen en fenotypes
- Allel Frequency Definition
- Bereken allelfrequentie
- Voorbeeldberekeningen
- Voorbeeld van genotypische frequenties
- Allel frequenties Voorbeeld
- Genotypische en allel frequenties interpreteren
Deoxyribonucleïnezuur, beter bekend als DNA, is een molecuul dat voorkomt in de grote meerderheid van levende organismen en virussen die op aarde worden aangetroffen. DNA draagt de genetische informatie, of de code, die alles maakt wat het is.
DNA verschilt tussen soorten en tussen individuen binnen een soort. Bij mensen bijvoorbeeld, bepaalt DNA de kleur van menselijke ogen, huid, haar, lengte en elk ander kenmerk dat elke persoon uniek maakt.
DNA, genen en allelen
DNA bestaat uit verschillende genen. Genen dragen de genetische informatie van elke ouder.
Elk gen wordt gevonden op een specifieke locus op een chromosoom. Een gen kan hebben meerdere variaties samengesteld uit verschillende allelsequenties.
Allelen en fenotypes
Allelen bepalen zichtbare individuele kenmerken, genaamd fenotypes. Blauw, groen, bruin en hazelaar zijn bijvoorbeeld allemaal verschillende fenotypes voor het menselijk oog.
Wanneer we kijken naar een van de vele genen voor oogkleur bij een groep mensen, zouden degenen met blauwe ogen een andere reeks allelen hebben dan die met bruine, hazelaar en groene ogen.
Allel Frequency Definition
De allelfrequentie is het aantal personen in een populatie met een specifiek allel type. Mensen gebruiken de allelfrequentieberekening om de snelheid te begrijpen die een fenotype in een populatie voorkomt.
Deze informatie geeft inzicht in de genetische diversiteit in een populatie. Wanneer allelfrequenties worden opgenomen in de tijd, kunnen veranderingen in genetische diversiteit worden waargenomen.
Bereken allelfrequentie
Om de allelfrequentie te berekenen, moet het totale aantal personen in de populatie worden geteld. Tel vervolgens het aantal individuen dat elk het specifieke fenotype in kwestie heeft.
Maak een telling van alle totalen. Om de allelfrequenties te vinden, deelt u het aantal keren dat een allel in een populatie wordt geteld door het totale aantal allelkopieën dat in dat gen is gevonden.
Voorbeeldberekeningen
Stel bijvoorbeeld dat er 100 individuen in een populatie zijn en twee soorten allelen, B voor blauwe ogen en G voor groene ogen. Elke persoon heeft twee kopieën van elk allel dus vermenigvuldig twee met 100 om 200 allelkopieën in de populatie te geven.
In het echte leven zijn er veel genen die coderen voor menselijke oogkleur, maar voor dit scenario zijn er slechts drie verschillende allelcombinaties in deze genenpool; BB, BG en GG. Tel vervolgens het aantal mensen in de populatie met elk alleltype.
Voorbeeld van genotypische frequenties
In dit voorbeeld zijn er 50 mensen met BB, 23 mensen met BG en 27 mensen met GG. Om de genotypische frequenties te vinden, deelt u eenvoudig het aantal mensen met een specifiek fenotype door het totale aantal mensen.
In dit geval betekent 50 BB gedeeld door 100 mensen dat 50 procent van de bevolking het BB-genotype heeft. De genfrequentie voor BG zou 23 procent zijn en 27 procent van de mensen in de genenpool zou het GG-gentype hebben.
Allel frequenties Voorbeeld
Terwijl genotypische frequenties kijken naar de expressie van de genen, kijken allelfrequenties naar het aantal keren dat een specifiek allel in een populatie voorkomt. Om de allelfrequentie van B in dit voorbeeld te vinden, vermenigvuldigt u 50 met twee omdat er twee Bs zijn in het BB-genotype.
Voeg vervolgens de mensen met het BG-genotype toe, want ze hebben ook elk een B-allel, wat een totaal van 123 B-allelen oplevert. Deel tenslotte 123 door 200 als elke persoon in de populatie heeft twee allelen, met een allelfrequentie van 0,615 of 61,5 procent.
Doe daarna hetzelfde voor het G-allel. Door de 27 mensen met GG-allelen met twee te vermenigvuldigen en de 23 mensen die ook een G-allel hebben toe te voegen, deel je dit getal, 77, door 200, met 0,385 of 38,5 procent.
Controleer op fouten door ervoor te zorgen dat alle allelfrequenties oplopen tot 1 of 100 procent. Hier is 61,5 toegevoegd aan 38,5 gelijk aan 100.
Genotypische en allel frequenties interpreteren
Deze berekeningen hebben de informatie opgeleverd over hoeveel mensen blauwe fenotype ogen hebben en hoeveel groene fenotype ogen hebben in deze populatie van 100 mensen. Uit de allelfrequenties is het duidelijk dat het B-allel dominanter is in een populatie.
Door deze studie in toekomstige generaties voort te zetten, zal het duidelijk worden of er veranderingen zijn in de allelfrequenties in de loop van de tijd en enig inzicht verschaffen in de evolutie van de bevolking.