Inhoud
- Hoe buffers werken
- Vereisten voor een buffer
- Een geschikte buffer selecteren
- De pH van een buffer wijzigen
- Voorbeelden van biologische buffers
In cellen en levende organismen worden de vloeistoffen rondom en in de cellen op een constante pH gehouden. De pH in dit systeem is vaak cruciaal voor de biochemische reacties die in het organisme optreden. Om biologische processen in het laboratorium te bestuderen, gebruiken wetenschappers buffers om de juiste pH tijdens het experiment te handhaven. Veel biologische buffers werden oorspronkelijk beschreven door Good en collega's in 1966 en worden nog steeds in laboratoria gebruikt.
Hoe buffers werken
Een buffer is eenvoudig een oplossing die een zwak zuur en zijn geconjugeerde base bevat. Wanneer een zuur aan de buffer wordt toegevoegd, reageert het met de geconjugeerde base waardoor een zwak zuur wordt gevormd en de pH van de oplossing nauwelijks wordt beïnvloed.
Vereisten voor een buffer
Een aantal kenmerken maakt een biologische buffer effectief. Ze moeten oplosbaar zijn in water, maar niet oplosbaar of minimaal oplosbaar in organische oplosmiddelen. De buffer mag niet door het celmembraan kunnen gaan, omdat dit het gedrag van de cel kan beïnvloeden. Buffers moeten niet-toxisch zijn, mogen geen UV-straling absorberen en moeten inert en stabiel blijven gedurende het experimentele proces. Temperatuur en ionische samenstelling mogen de pH of buffercapaciteit niet veranderen.
Een geschikte buffer selecteren
De gekozen buffer moet een pKa hebben in het optimale bereik voor het te bestuderen proces. Een buffer met een hogere pKa is geschikt als het waarschijnlijk is dat de pH tijdens het experiment stijgt en omgekeerd als de pH naar verwachting zal dalen. Bufferconcentraties moeten worden geoptimaliseerd, omdat concentraties hoger dan 25 mM mogelijk een betere buffercapaciteit hebben maar cellulaire activiteiten zoals enzymen kunnen remmen. De methode bepaalt ook welke buffer moet worden gebruikt; bij elektroforese is bijvoorbeeld een buffer met een lage ionsterkte geschikt om te voorkomen dat de gelmatrix opwarmt.
De pH van een buffer wijzigen
Omdat de pH kan veranderen met temperatuurveranderingen, moeten wetenschappers de pH van de buffers testen op de temperatuur waarbij ze het experiment uitvoeren. Tris is een buffer die vooral gevoelig is voor verandering van pH met temperatuur. Alle pH-meters moeten op de bedrijfstemperatuur worden gekalibreerd. Additieven kunnen ook de pH veranderen, waardoor opnieuw testen noodzakelijk is. Om de pH te veranderen wordt een zuur, gewoonlijk zoutzuur, of base, gewoonlijk natrium- of kaliumhydroxide, toegevoegd; dit moet langzaam worden gedaan om inactivering of chemische veranderingen in de buffer te voorkomen.
Voorbeelden van biologische buffers
TE-buffer, die 10 mM Tris-HCl en 1 mM EDTA is, is geschikt bij een aantal pH-waarden voor de opslag van nucleïnezuren. Elektroforese is een veel voorkomende methode voor de studie van eiwitten of nucleïnezuren; dit proces maakt gebruik van een aantal buffers, waaronder Tris-acetaat-EDTA, Tris-glycine en Tris-boraat-EDTA-buffers. Deze buffers voorkomen de verwarming van de gelmatrix en kunnen additieven zoals ureum en SDS bevatten, afhankelijk van het onderzoek.